La definicion de "Las mejores" puede que sea distinto para distinta gente. Algunas universidades puede que esten mas volcadas hacia la Investigacion basica, otras quiza tengan mayor interaccion con la industria. Algunas son quiza muy famosas y cobran aranceles mayores que otras, al ser famosas en algunos contextos esto puede se favorable, pero la calidad de la ensenanza no es necesariamente superior que otra que cobra menos o la suniversidades gratuitas. La mejor opcion quiza depende de cuales son tus aspiraciones profesionales.

Hay algunos rankings, sobre todo de las de EEUU que varian de año a año y dan mas o menos una idea de la reputacion de cada universidad.
http://en.wikipedia.org/wiki/College_and_university_rankings

En Argentina no se si hay algo similar puedes guiarte por las acreditaciones de la CONEAU. Por ejemplo la Universidad del Litoral es
http://www.coneau.gov.ar/archivos/resoluciones/Res757-04e804-474.pdf